有资质的父子亲子鉴定，主要有以下几种方法：
1、DNA比对分析。DNA比对分析是通过比对成人和子女的亲子间的私有基因序列，来确认有关一方或者双方的血缘亲属关系。DNA比对准确性非常高，可以确定父子关系。
2、血型比对分析，是通过比对父子间的ABO血型来判断其亲子关系。血型鉴定可以提供一定的参考价值，但是，由于血型分型变异较小，所以准确性不够高。
3、分子遗传学鉴定技术，是根据亲子之间一些特殊的遗传规律，来进行血缘关系的判断。分子遗传学鉴定也是一种可靠的鉴定手段，可以对父子亲子关系进行准确的鉴定和判断。
4、多位点分型鉴定，是指取母亲、父亲和子女之间多处位点基因型进行比对，来判断亲子间血缘关系的一种方法。多位点分型鉴定技术目前是亲子鉴定中比较准确的技术，广泛应用于公安、司法、医疗、生命科学等领域。
以上也是常用的几种父子亲子鉴定方法，其中DNA比对分析在鉴定父子关系上最准确，也是最经常用的一种鉴定方式。但为了能更准确的判断，需要综合多种检测方法，以达到更准确的最终结果。
有资质的父子亲子鉴定有很多方法。首先是血缘亲子鉴定。血缘亲子鉴定主要是根据亲子之间的种族，出产地，基因特征或者分子数据，做出判断，利用传统的血细胞凝集 分析， 基因分析， 人类基因组计划等，可以准确判断亲子的血缘关系。其次是婚育证明。婚育证明可以根据亲子出生前婚姻状况是否有登记，如果有登记，可以有效地证明是否真正的亲子关系。最后，生物特征亲子鉴定方法是通过多种形式的生物特征，如DNA分析、血型分析等，来确定父子的血缘关系。总结一句，有资质的父子亲子鉴定的方法有血缘亲子鉴定、婚育证明，以及生物特征亲子鉴定。
有资质的父子亲子鉴定主要通过遗传学原理，利用DNA分子的特异性来确认亲子关系，常见的方法包括以下几种：
1. 口腔拭子样本鉴定：这是最常用的无创采样方式，通过采集被鉴定人的口腔黏膜细胞（使用无菌拭子擦拭口腔内侧）获取DNA。操作简便、无痛，适合各个年龄段人群，样本稳定性较好，准确率可达99.99%以上。
2. 血液样本鉴定：采集静脉血或末梢血（如指尖血），从中提取白细胞中的DNA进行检测。血液样本DNA含量丰富，检测结果稳定，但采样需专业操作，对婴幼儿或惧针者可能存在一定不便。
3. 毛发样本鉴定：需采集带有毛囊的毛发（如头发），毛囊中含有足量的DNA。采样时需确保毛发根部带有白色毛囊，且避免污染，适合不便采集血液或口腔拭子的情况，但需注意毛发样本可能因保存不当导致DNA降解。
4. 特殊样本鉴定：在常规样本无法获取时，可使用特殊样本如指甲、牙刷、精液、口香糖残渣等。这类样本的DNA提取难度较高，对实验室技术要求严格，需确保样本未受污染且含有足量DNA，鉴定结果准确性与常规样本一致。
无论选择哪种方法，均需在有资质的机构进行，确保采样规范、检测流程合规，以保证结果的准确性和法律效力。不同样本的选择需根据实际情况和机构要求确定，鉴定过程通常包括DNA提取、PCR扩增、基因分型等步骤，最终通过数据分析得出亲子关系概率。
